In de Zijlsterkerk vind je drie moderne kamers met een ruime ontbijtzaal waar alle karakteristieke elementen van kerk zichtbaar zijn. Zo zijn de hoge raampartijen, de originele preekstoel en tal van historische elementen in oude stijl gebleven. Geniet in de bovenruimte, waar voorheen het orgel stond, van een drankje bij de houtkachel. De kamers, die elk genoemd zijn naar de historische elementen van Munnekezijl, bieden al het comfort voor een fijne overnachting.
De kerk is vlakbij de historische sluis van Munnekezijl gevestigd. Voor activiteiten kun je te kust en te keur terecht: trek er op uit naar het waterrijke Lauwersmeergebied of beleef de groene natuur van het coulisselandschap. De locatie is zeer geschikt voor heerlijke wandel- of fietstochten. Of breng een bezoek aan het nabij gelegen vissersdorp Zoutkamp en de Elfstedenstad Dokkum.
De Zijlsterkerk is daarnaast ook beschikbaar voor andere activiteiten, zoals feestelijke gelegenheden of vergaderen.
